Puis une navette nous amène à l'ancien monastère. Il est étonnant de par son emplacement à flanc de falaise et semi enfoncé dans la roche. En raison de son ancienneté et de son emplacement, le plan du monastère est très atypique. Saint-Jean était l'un des monastères les plus influents de l'Espagne chrétienne au XIe et XIIe siècles ; il accueille les sépultures d'une grande partie des souverains d'Aragon.